Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms