Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSEN1P49768 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSEN1P49768 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSEN1P49768 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms