Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPFP49454 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPFP49454 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPFP49454 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPFP49454 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPFP49454 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPFP49454 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPFP49454 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPFP49454 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPFP49454 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPFP49454 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPFP49454 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPFP49454 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPFP49454 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPFP49454 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPFP49454 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPFP49454 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPFP49454 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPFP49454 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPFP49454 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPFP49454 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPFP49454 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPFP49454 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPFP49454 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPFP49454 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPFP49454 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPFP49454 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPFP49454 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPFP49454 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPFP49454 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPFP49454 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPFP49454 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CENPFP49454 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPFP49454 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPFP49454 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CENPFP49454 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CENPFP49454 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CENPFP49454 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPFP49454 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPFP49454 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPFP49454 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPFP49454 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPFP49454 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPFP49454 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPFP49454 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPFP49454 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPFP49454 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPFP49454 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPFP49454 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPFP49454 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPFP49454 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPFP49454 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPFP49454 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPFP49454 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPFP49454 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPFP49454 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPFP49454 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPFP49454 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPFP49454 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPFP49454 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPFP49454 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPFP49454 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPFP49454 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPFP49454 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPFP49454 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPFP49454 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPFP49454 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPFP49454 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPFP49454 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPFP49454 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPFP49454 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPFP49454 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPFP49454 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPFP49454 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPFP49454 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPFP49454 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPFP49454 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPFP49454 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPFP49454 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPFP49454 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPFP49454 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPFP49454 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPFP49454 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPFP49454 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPFP49454 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CENPFP49454 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPFP49454 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPFP49454 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPFP49454 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPFP49454 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPFP49454 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPFP49454 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPFP49454 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPFP49454 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPFP49454 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPFP49454 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPFP49454 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPFP49454 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPFP49454 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPFP49454 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms