Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNI2P48788 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms