Protein–RNA interactions for Protein: P48547

KCNC1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC1P48547 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNC1P48547 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KCNC1P48547 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNC1P48547 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms