Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCLMP48507 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCLMP48507 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCLMP48507 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GCLMP48507 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCLMP48507 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCLMP48507 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCLMP48507 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLMP48507 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLMP48507 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLMP48507 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLMP48507 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLMP48507 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLMP48507 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLMP48507 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLMP48507 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLMP48507 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLMP48507 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLMP48507 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLMP48507 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCLMP48507 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GCLMP48507 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCLMP48507 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCLMP48507 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCLMP48507 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCLMP48507 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCLMP48507 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCLMP48507 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCLMP48507 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCLMP48507 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCLMP48507 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCLMP48507 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GCLMP48507 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCLMP48507 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCLMP48507 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCLMP48507 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCLMP48507 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCLMP48507 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCLMP48507 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCLMP48507 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCLMP48507 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCLMP48507 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCLMP48507 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCLMP48507 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCLMP48507 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCLMP48507 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCLMP48507 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCLMP48507 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCLMP48507 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCLMP48507 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCLMP48507 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCLMP48507 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCLMP48507 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCLMP48507 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCLMP48507 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCLMP48507 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GCLMP48507 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCLMP48507 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCLMP48507 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCLMP48507 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCLMP48507 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCLMP48507 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCLMP48507 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCLMP48507 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCLMP48507 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GCLMP48507 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCLMP48507 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCLMP48507 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCLMP48507 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCLMP48507 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCLMP48507 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GCLMP48507 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GCLMP48507 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCLMP48507 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCLMP48507 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCLMP48507 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCLMP48507 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCLMP48507 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCLMP48507 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCLMP48507 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCLMP48507 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCLMP48507 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCLMP48507 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCLMP48507 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCLMP48507 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCLMP48507 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GCLMP48507 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCLMP48507 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCLMP48507 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GCLMP48507 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCLMP48507 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCLMP48507 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCLMP48507 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCLMP48507 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCLMP48507 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCLMP48507 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCLMP48507 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCLMP48507 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCLMP48507 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCLMP48507 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms