Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRGP48443 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRGP48443 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRGP48443 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRGP48443 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRGP48443 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRGP48443 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRGP48443 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRGP48443 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRGP48443 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRGP48443 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRGP48443 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRGP48443 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRGP48443 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRGP48443 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRGP48443 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRGP48443 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRGP48443 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRGP48443 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RXRGP48443 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RXRGP48443 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RXRGP48443 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RXRGP48443 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RXRGP48443 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RXRGP48443 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RXRGP48443 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RXRGP48443 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RXRGP48443 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
RXRGP48443 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RXRGP48443 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRGP48443 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRGP48443 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRGP48443 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRGP48443 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRGP48443 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRGP48443 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRGP48443 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRGP48443 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRGP48443 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRGP48443 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRGP48443 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRGP48443 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRGP48443 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRGP48443 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRGP48443 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRGP48443 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRGP48443 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRGP48443 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRGP48443 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRGP48443 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRGP48443 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRGP48443 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRGP48443 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRGP48443 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRGP48443 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRGP48443 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRGP48443 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRGP48443 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRGP48443 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRGP48443 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRGP48443 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRGP48443 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRGP48443 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRGP48443 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRGP48443 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRGP48443 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRGP48443 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RXRGP48443 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RXRGP48443 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RXRGP48443 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RXRGP48443 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RXRGP48443 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RXRGP48443 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RXRGP48443 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RXRGP48443 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RXRGP48443 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RXRGP48443 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RXRGP48443 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RXRGP48443 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RXRGP48443 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RXRGP48443 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RXRGP48443 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RXRGP48443 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RXRGP48443 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RXRGP48443 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RXRGP48443 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RXRGP48443 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RXRGP48443 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RXRGP48443 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RXRGP48443 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RXRGP48443 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RXRGP48443 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RXRGP48443 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RXRGP48443 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RXRGP48443 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RXRGP48443 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RXRGP48443 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RXRGP48443 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RXRGP48443 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RXRGP48443 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms