Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRXP46100 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRXP46100 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRXP46100 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRXP46100 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRXP46100 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRXP46100 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRXP46100 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRXP46100 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRXP46100 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRXP46100 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRXP46100 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRXP46100 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATRXP46100 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATRXP46100 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATRXP46100 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATRXP46100 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATRXP46100 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATRXP46100 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATRXP46100 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATRXP46100 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
ATRXP46100 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATRXP46100 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRXP46100 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRXP46100 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRXP46100 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRXP46100 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRXP46100 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRXP46100 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRXP46100 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRXP46100 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRXP46100 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRXP46100 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRXP46100 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRXP46100 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRXP46100 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRXP46100 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRXP46100 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRXP46100 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRXP46100 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRXP46100 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRXP46100 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRXP46100 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRXP46100 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRXP46100 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRXP46100 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRXP46100 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRXP46100 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRXP46100 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRXP46100 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRXP46100 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRXP46100 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRXP46100 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRXP46100 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRXP46100 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRXP46100 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRXP46100 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRXP46100 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRXP46100 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRXP46100 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRXP46100 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRXP46100 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRXP46100 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRXP46100 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRXP46100 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRXP46100 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRXP46100 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRXP46100 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRXP46100 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRXP46100 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRXP46100 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRXP46100 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRXP46100 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRXP46100 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRXP46100 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRXP46100 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRXP46100 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRXP46100 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRXP46100 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRXP46100 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRXP46100 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRXP46100 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRXP46100 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRXP46100 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRXP46100 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRXP46100 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRXP46100 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRXP46100 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRXP46100 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRXP46100 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRXP46100 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRXP46100 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRXP46100 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRXP46100 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRXP46100 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRXP46100 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRXP46100 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRXP46100 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRXP46100 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRXP46100 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms