Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATA4P43694 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATA4P43694 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATA4P43694 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATA4P43694 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATA4P43694 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATA4P43694 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GATA4P43694 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATA4P43694 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATA4P43694 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATA4P43694 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATA4P43694 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATA4P43694 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATA4P43694 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATA4P43694 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATA4P43694 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATA4P43694 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATA4P43694 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATA4P43694 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATA4P43694 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATA4P43694 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATA4P43694 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATA4P43694 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATA4P43694 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATA4P43694 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATA4P43694 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATA4P43694 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATA4P43694 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATA4P43694 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATA4P43694 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATA4P43694 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATA4P43694 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATA4P43694 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATA4P43694 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATA4P43694 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATA4P43694 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATA4P43694 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GATA4P43694 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GATA4P43694 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATA4P43694 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATA4P43694 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATA4P43694 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATA4P43694 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATA4P43694 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATA4P43694 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATA4P43694 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATA4P43694 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATA4P43694 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATA4P43694 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATA4P43694 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATA4P43694 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATA4P43694 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GATA4P43694 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATA4P43694 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATA4P43694 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATA4P43694 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATA4P43694 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATA4P43694 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATA4P43694 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATA4P43694 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GATA4P43694 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATA4P43694 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATA4P43694 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATA4P43694 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATA4P43694 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATA4P43694 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATA4P43694 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATA4P43694 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATA4P43694 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATA4P43694 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATA4P43694 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATA4P43694 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATA4P43694 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATA4P43694 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATA4P43694 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATA4P43694 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATA4P43694 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATA4P43694 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATA4P43694 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATA4P43694 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATA4P43694 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATA4P43694 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GATA4P43694 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATA4P43694 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATA4P43694 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATA4P43694 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GATA4P43694 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GATA4P43694 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATA4P43694 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATA4P43694 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GATA4P43694 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GATA4P43694 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATA4P43694 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATA4P43694 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GATA4P43694 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATA4P43694 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATA4P43694 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATA4P43694 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATA4P43694 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATA4P43694 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms