Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AFMP43652 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AFMP43652 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AFMP43652 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AFMP43652 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AFMP43652 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
AFMP43652 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AFMP43652 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AFMP43652 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AFMP43652 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AFMP43652 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AFMP43652 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AFMP43652 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AFMP43652 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AFMP43652 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AFMP43652 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
AFMP43652 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AFMP43652 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AFMP43652 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
AFMP43652 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AFMP43652 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AFMP43652 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AFMP43652 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AFMP43652 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AFMP43652 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AFMP43652 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AFMP43652 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AFMP43652 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AFMP43652 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AFMP43652 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AFMP43652 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AFMP43652 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AFMP43652 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AFMP43652 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AFMP43652 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AFMP43652 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AFMP43652 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFMP43652 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFMP43652 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFMP43652 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFMP43652 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFMP43652 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFMP43652 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFMP43652 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFMP43652 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFMP43652 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFMP43652 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFMP43652 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFMP43652 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFMP43652 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFMP43652 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
AFMP43652 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFMP43652 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFMP43652 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFMP43652 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFMP43652 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
AFMP43652 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFMP43652 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFMP43652 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFMP43652 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFMP43652 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
AFMP43652 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFMP43652 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFMP43652 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFMP43652 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFMP43652 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFMP43652 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
AFMP43652 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
AFMP43652 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
AFMP43652 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFMP43652 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFMP43652 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
AFMP43652 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFMP43652 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFMP43652 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFMP43652 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFMP43652 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFMP43652 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFMP43652 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFMP43652 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFMP43652 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFMP43652 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
AFMP43652 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFMP43652 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFMP43652 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFMP43652 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
AFMP43652 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFMP43652 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFMP43652 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFMP43652 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFMP43652 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AFMP43652 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFMP43652 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFMP43652 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFMP43652 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
AFMP43652 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
AFMP43652 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
AFMP43652 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
AFMP43652 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFMP43652 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms