Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF5P43026 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF5P43026 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF5P43026 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF5P43026 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF5P43026 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF5P43026 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF5P43026 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF5P43026 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF5P43026 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF5P43026 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF5P43026 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF5P43026 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF5P43026 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF5P43026 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF5P43026 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF5P43026 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF5P43026 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF5P43026 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF5P43026 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF5P43026 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF5P43026 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF5P43026 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF5P43026 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF5P43026 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF5P43026 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GDF5P43026 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF5P43026 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF5P43026 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF5P43026 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF5P43026 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF5P43026 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF5P43026 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF5P43026 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF5P43026 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF5P43026 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF5P43026 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF5P43026 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF5P43026 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF5P43026 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF5P43026 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GDF5P43026 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF5P43026 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF5P43026 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF5P43026 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GDF5P43026 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF5P43026 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF5P43026 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF5P43026 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
GDF5P43026 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GDF5P43026 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GDF5P43026 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF5P43026 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GDF5P43026 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF5P43026 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF5P43026 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF5P43026 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF5P43026 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF5P43026 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF5P43026 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GDF5P43026 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF5P43026 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF5P43026 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF5P43026 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF5P43026 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF5P43026 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF5P43026 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF5P43026 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF5P43026 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF5P43026 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF5P43026 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF5P43026 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF5P43026 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF5P43026 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF5P43026 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GDF5P43026 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF5P43026 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF5P43026 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF5P43026 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF5P43026 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF5P43026 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF5P43026 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF5P43026 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF5P43026 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GDF5P43026 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF5P43026 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF5P43026 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF5P43026 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF5P43026 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF5P43026 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF5P43026 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF5P43026 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF5P43026 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF5P43026 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF5P43026 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF5P43026 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF5P43026 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF5P43026 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF5P43026 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF5P43026 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms