Protein–RNA interactions for Protein: P40939

HADHA, Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHAP40939 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHAP40939 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHAP40939 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHAP40939 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHAP40939 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHAP40939 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HADHAP40939 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HADHAP40939 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HADHAP40939 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HADHAP40939 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HADHAP40939 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HADHAP40939 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HADHAP40939 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HADHAP40939 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HADHAP40939 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HADHAP40939 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HADHAP40939 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HADHAP40939 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HADHAP40939 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HADHAP40939 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HADHAP40939 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HADHAP40939 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HADHAP40939 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HADHAP40939 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HADHAP40939 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HADHAP40939 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HADHAP40939 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HADHAP40939 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HADHAP40939 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HADHAP40939 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HADHAP40939 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HADHAP40939 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HADHAP40939 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HADHAP40939 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HADHAP40939 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HADHAP40939 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HADHAP40939 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HADHAP40939 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HADHAP40939 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HADHAP40939 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HADHAP40939 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HADHAP40939 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HADHAP40939 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HADHAP40939 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HADHAP40939 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HADHAP40939 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HADHAP40939 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HADHAP40939 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HADHAP40939 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HADHAP40939 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HADHAP40939 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HADHAP40939 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HADHAP40939 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HADHAP40939 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HADHAP40939 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HADHAP40939 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HADHAP40939 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HADHAP40939 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HADHAP40939 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
HADHAP40939 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HADHAP40939 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HADHAP40939 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HADHAP40939 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HADHAP40939 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HADHAP40939 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
HADHAP40939 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HADHAP40939 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HADHAP40939 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HADHAP40939 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HADHAP40939 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HADHAP40939 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HADHAP40939 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HADHAP40939 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HADHAP40939 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HADHAP40939 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HADHAP40939 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HADHAP40939 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HADHAP40939 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HADHAP40939 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HADHAP40939 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HADHAP40939 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HADHAP40939 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HADHAP40939 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HADHAP40939 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HADHAP40939 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HADHAP40939 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HADHAP40939 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HADHAP40939 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HADHAP40939 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HADHAP40939 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HADHAP40939 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HADHAP40939 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HADHAP40939 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HADHAP40939 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HADHAP40939 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HADHAP40939 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HADHAP40939 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HADHAP40939 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HADHAP40939 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HADHAP40939 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms