Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HSPA9P38646 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HSPA9P38646 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms