Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FLT4P35916 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FLT4P35916 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FLT4P35916 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FLT4P35916 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FLT4P35916 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FLT4P35916 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
FLT4P35916 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FLT4P35916 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FLT4P35916 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FLT4P35916 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
FLT4P35916 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FLT4P35916 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FLT4P35916 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
FLT4P35916 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FLT4P35916 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FLT4P35916 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FLT4P35916 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FLT4P35916 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FLT4P35916 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FLT4P35916 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FLT4P35916 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FLT4P35916 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
FLT4P35916 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FLT4P35916 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FLT4P35916 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FLT4P35916 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FLT4P35916 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
FLT4P35916 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FLT4P35916 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FLT4P35916 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FLT4P35916 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FLT4P35916 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FLT4P35916 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
FLT4P35916 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FLT4P35916 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FLT4P35916 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FLT4P35916 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FLT4P35916 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FLT4P35916 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FLT4P35916 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FLT4P35916 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FLT4P35916 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FLT4P35916 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
FLT4P35916 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FLT4P35916 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FLT4P35916 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FLT4P35916 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FLT4P35916 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FLT4P35916 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FLT4P35916 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FLT4P35916 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FLT4P35916 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FLT4P35916 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FLT4P35916 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FLT4P35916 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FLT4P35916 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FLT4P35916 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FLT4P35916 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FLT4P35916 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FLT4P35916 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FLT4P35916 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FLT4P35916 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FLT4P35916 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FLT4P35916 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FLT4P35916 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FLT4P35916 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FLT4P35916 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FLT4P35916 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FLT4P35916 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FLT4P35916 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FLT4P35916 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FLT4P35916 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FLT4P35916 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FLT4P35916 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
FLT4P35916 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
FLT4P35916 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FLT4P35916 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FLT4P35916 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FLT4P35916 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FLT4P35916 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FLT4P35916 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FLT4P35916 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FLT4P35916 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FLT4P35916 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
FLT4P35916 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
FLT4P35916 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FLT4P35916 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FLT4P35916 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FLT4P35916 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FLT4P35916 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FLT4P35916 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FLT4P35916 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FLT4P35916 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FLT4P35916 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FLT4P35916 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FLT4P35916 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FLT4P35916 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FLT4P35916 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FLT4P35916 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms