Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYLC1P35663 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms