Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD13P35453 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD13P35453 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD13P35453 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms