Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RDXP35241 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RDXP35241 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RDXP35241 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RDXP35241 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RDXP35241 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RDXP35241 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RDXP35241 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RDXP35241 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RDXP35241 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RDXP35241 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RDXP35241 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RDXP35241 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RDXP35241 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RDXP35241 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RDXP35241 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RDXP35241 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RDXP35241 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RDXP35241 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RDXP35241 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RDXP35241 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RDXP35241 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RDXP35241 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RDXP35241 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RDXP35241 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RDXP35241 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RDXP35241 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RDXP35241 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RDXP35241 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RDXP35241 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RDXP35241 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RDXP35241 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RDXP35241 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RDXP35241 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RDXP35241 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RDXP35241 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RDXP35241 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RDXP35241 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RDXP35241 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RDXP35241 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RDXP35241 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RDXP35241 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RDXP35241 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RDXP35241 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RDXP35241 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RDXP35241 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RDXP35241 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RDXP35241 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RDXP35241 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RDXP35241 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RDXP35241 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RDXP35241 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RDXP35241 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RDXP35241 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RDXP35241 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RDXP35241 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RDXP35241 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RDXP35241 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RDXP35241 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RDXP35241 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RDXP35241 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RDXP35241 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RDXP35241 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RDXP35241 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RDXP35241 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RDXP35241 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RDXP35241 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RDXP35241 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RDXP35241 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RDXP35241 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RDXP35241 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RDXP35241 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RDXP35241 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RDXP35241 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RDXP35241 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RDXP35241 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RDXP35241 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RDXP35241 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RDXP35241 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RDXP35241 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RDXP35241 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RDXP35241 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RDXP35241 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RDXP35241 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RDXP35241 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RDXP35241 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RDXP35241 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RDXP35241 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RDXP35241 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RDXP35241 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RDXP35241 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RDXP35241 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RDXP35241 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RDXP35241 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RDXP35241 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RDXP35241 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RDXP35241 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RDXP35241 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RDXP35241 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RDXP35241 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms