Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTNNB1P35222 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNB1P35222 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms