Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL9P32969 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL9P32969 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL9P32969 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL9P32969 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL9P32969 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL9P32969 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL9P32969 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL9P32969 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL9P32969 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL9P32969 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL9P32969 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL9P32969 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL9P32969 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL9P32969 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL9P32969 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL9P32969 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL9P32969 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPL9P32969 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL9P32969 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL9P32969 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL9P32969 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL9P32969 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL9P32969 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL9P32969 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL9P32969 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL9P32969 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL9P32969 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL9P32969 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL9P32969 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL9P32969 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL9P32969 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL9P32969 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL9P32969 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL9P32969 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL9P32969 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL9P32969 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL9P32969 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL9P32969 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL9P32969 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL9P32969 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL9P32969 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL9P32969 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL9P32969 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL9P32969 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL9P32969 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL9P32969 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL9P32969 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL9P32969 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL9P32969 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL9P32969 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL9P32969 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL9P32969 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL9P32969 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL9P32969 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL9P32969 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL9P32969 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL9P32969 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL9P32969 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL9P32969 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL9P32969 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL9P32969 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL9P32969 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL9P32969 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL9P32969 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL9P32969 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL9P32969 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL9P32969 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL9P32969 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL9P32969 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL9P32969 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL9P32969 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL9P32969 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL9P32969 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL9P32969 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL9P32969 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL9P32969 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL9P32969 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL9P32969 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL9P32969 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL9P32969 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL9P32969 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL9P32969 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL9P32969 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL9P32969 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL9P32969 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL9P32969 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL9P32969 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL9P32969 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL9P32969 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPL9P32969 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPL9P32969 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPL9P32969 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPL9P32969 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RPL9P32969 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPL9P32969 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPL9P32969 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPL9P32969 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPL9P32969 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPL9P32969 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms