Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DSG3P32926 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DSG3P32926 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DSG3P32926 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DSG3P32926 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DSG3P32926 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DSG3P32926 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSG3P32926 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSG3P32926 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSG3P32926 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSG3P32926 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSG3P32926 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSG3P32926 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSG3P32926 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSG3P32926 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSG3P32926 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSG3P32926 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSG3P32926 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSG3P32926 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSG3P32926 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSG3P32926 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSG3P32926 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSG3P32926 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSG3P32926 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSG3P32926 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSG3P32926 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSG3P32926 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSG3P32926 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSG3P32926 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DSG3P32926 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSG3P32926 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSG3P32926 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSG3P32926 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSG3P32926 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSG3P32926 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSG3P32926 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DSG3P32926 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSG3P32926 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSG3P32926 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSG3P32926 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DSG3P32926 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSG3P32926 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSG3P32926 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSG3P32926 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DSG3P32926 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DSG3P32926 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DSG3P32926 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DSG3P32926 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DSG3P32926 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DSG3P32926 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DSG3P32926 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DSG3P32926 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DSG3P32926 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DSG3P32926 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DSG3P32926 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DSG3P32926 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DSG3P32926 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DSG3P32926 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DSG3P32926 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DSG3P32926 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DSG3P32926 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DSG3P32926 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DSG3P32926 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DSG3P32926 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DSG3P32926 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DSG3P32926 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DSG3P32926 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DSG3P32926 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DSG3P32926 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DSG3P32926 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DSG3P32926 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DSG3P32926 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DSG3P32926 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DSG3P32926 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DSG3P32926 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DSG3P32926 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DSG3P32926 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DSG3P32926 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DSG3P32926 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DSG3P32926 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DSG3P32926 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DSG3P32926 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DSG3P32926 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DSG3P32926 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DSG3P32926 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DSG3P32926 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DSG3P32926 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DSG3P32926 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DSG3P32926 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DSG3P32926 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DSG3P32926 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DSG3P32926 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DSG3P32926 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DSG3P32926 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DSG3P32926 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DSG3P32926 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DSG3P32926 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DSG3P32926 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DSG3P32926 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DSG3P32926 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms