Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCKARP32238 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCKARP32238 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCKARP32238 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCKARP32238 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCKARP32238 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCKARP32238 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCKARP32238 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCKARP32238 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCKARP32238 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCKARP32238 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCKARP32238 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCKARP32238 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCKARP32238 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCKARP32238 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCKARP32238 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCKARP32238 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCKARP32238 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCKARP32238 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCKARP32238 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCKARP32238 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCKARP32238 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCKARP32238 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCKARP32238 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCKARP32238 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCKARP32238 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCKARP32238 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCKARP32238 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCKARP32238 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCKARP32238 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCKARP32238 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCKARP32238 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCKARP32238 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCKARP32238 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCKARP32238 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCKARP32238 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCKARP32238 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCKARP32238 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCKARP32238 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCKARP32238 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCKARP32238 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCKARP32238 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCKARP32238 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCKARP32238 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCKARP32238 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCKARP32238 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCKARP32238 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCKARP32238 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCKARP32238 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCKARP32238 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCKARP32238 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCKARP32238 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCKARP32238 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCKARP32238 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCKARP32238 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCKARP32238 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCKARP32238 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCKARP32238 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCKARP32238 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCKARP32238 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCKARP32238 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCKARP32238 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCKARP32238 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCKARP32238 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCKARP32238 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCKARP32238 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCKARP32238 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCKARP32238 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCKARP32238 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCKARP32238 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCKARP32238 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCKARP32238 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCKARP32238 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCKARP32238 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCKARP32238 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCKARP32238 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCKARP32238 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCKARP32238 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCKARP32238 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCKARP32238 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCKARP32238 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCKARP32238 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCKARP32238 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCKARP32238 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCKARP32238 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCKARP32238 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCKARP32238 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCKARP32238 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCKARP32238 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCKARP32238 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCKARP32238 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCKARP32238 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCKARP32238 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCKARP32238 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCKARP32238 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCKARP32238 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCKARP32238 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCKARP32238 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCKARP32238 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCKARP32238 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms