Protein–RNA interactions for Protein: P32189

GK, Glycerol kinase, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKP32189 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GKP32189 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GKP32189 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GKP32189 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GKP32189 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GKP32189 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GKP32189 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GKP32189 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GKP32189 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GKP32189 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GKP32189 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GKP32189 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GKP32189 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GKP32189 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GKP32189 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GKP32189 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GKP32189 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GKP32189 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GKP32189 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GKP32189 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GKP32189 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GKP32189 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GKP32189 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GKP32189 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GKP32189 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GKP32189 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GKP32189 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GKP32189 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GKP32189 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GKP32189 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GKP32189 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GKP32189 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GKP32189 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GKP32189 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GKP32189 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GKP32189 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GKP32189 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GKP32189 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GKP32189 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GKP32189 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GKP32189 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GKP32189 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GKP32189 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GKP32189 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GKP32189 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GKP32189 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GKP32189 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GKP32189 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GKP32189 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GKP32189 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GKP32189 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GKP32189 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GKP32189 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GKP32189 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKP32189 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKP32189 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKP32189 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKP32189 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKP32189 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKP32189 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKP32189 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKP32189 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKP32189 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKP32189 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKP32189 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKP32189 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKP32189 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKP32189 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKP32189 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKP32189 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKP32189 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GKP32189 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GKP32189 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GKP32189 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GKP32189 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GKP32189 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GKP32189 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GKP32189 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GKP32189 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GKP32189 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GKP32189 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GKP32189 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GKP32189 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GKP32189 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GKP32189 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GKP32189 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GKP32189 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GKP32189 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKP32189 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKP32189 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKP32189 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKP32189 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKP32189 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKP32189 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GKP32189 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKP32189 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GKP32189 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKP32189 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKP32189 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GKP32189 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms