Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
L1CAMP32004 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
L1CAMP32004 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms