Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC13P31276 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms