Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXA11P31270 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXA11P31270 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA11P31270 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA11P31270 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA11P31270 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA11P31270 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA11P31270 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA11P31270 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA11P31270 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA11P31270 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA11P31270 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA11P31270 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA11P31270 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA11P31270 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA11P31270 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA11P31270 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA11P31270 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA11P31270 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA11P31270 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA11P31270 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA11P31270 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA11P31270 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA11P31270 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA11P31270 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA11P31270 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA11P31270 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA11P31270 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA11P31270 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA11P31270 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA11P31270 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA11P31270 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms