Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA9P31269 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA9P31269 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA9P31269 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms