Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA7P31268 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms