Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCND2P30279 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCND2P30279 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCND2P30279 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCND2P30279 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCND2P30279 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCND2P30279 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCND2P30279 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCND2P30279 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCND2P30279 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCND2P30279 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCND2P30279 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCND2P30279 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCND2P30279 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCND2P30279 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCND2P30279 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCND2P30279 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCND2P30279 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCND2P30279 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCND2P30279 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCND2P30279 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCND2P30279 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCND2P30279 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCND2P30279 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCND2P30279 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCND2P30279 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCND2P30279 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCND2P30279 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCND2P30279 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCND2P30279 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCND2P30279 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCND2P30279 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCND2P30279 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCND2P30279 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCND2P30279 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCND2P30279 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCND2P30279 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCND2P30279 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCND2P30279 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCND2P30279 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCND2P30279 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCND2P30279 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCND2P30279 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCND2P30279 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCND2P30279 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCND2P30279 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCND2P30279 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCND2P30279 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND2P30279 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND2P30279 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND2P30279 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND2P30279 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND2P30279 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND2P30279 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND2P30279 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND2P30279 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND2P30279 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND2P30279 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND2P30279 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCND2P30279 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCND2P30279 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCND2P30279 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCND2P30279 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCND2P30279 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCND2P30279 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCND2P30279 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCND2P30279 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCND2P30279 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCND2P30279 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCND2P30279 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCND2P30279 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCND2P30279 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCND2P30279 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCND2P30279 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCND2P30279 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCND2P30279 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCND2P30279 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCND2P30279 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCND2P30279 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCND2P30279 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCND2P30279 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCND2P30279 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCND2P30279 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCND2P30279 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCND2P30279 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCND2P30279 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCND2P30279 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCND2P30279 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCND2P30279 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCND2P30279 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCND2P30279 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCND2P30279 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCND2P30279 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCND2P30279 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCND2P30279 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCND2P30279 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCND2P30279 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCND2P30279 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCND2P30279 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCND2P30279 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms