Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms