Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMB9P28065 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMB9P28065 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms