Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARK3P27448 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MARK3P27448 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARK3P27448 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARK3P27448 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARK3P27448 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARK3P27448 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARK3P27448 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARK3P27448 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARK3P27448 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARK3P27448 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARK3P27448 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARK3P27448 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARK3P27448 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARK3P27448 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MARK3P27448 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARK3P27448 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARK3P27448 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARK3P27448 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARK3P27448 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARK3P27448 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARK3P27448 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARK3P27448 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARK3P27448 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARK3P27448 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARK3P27448 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MARK3P27448 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARK3P27448 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARK3P27448 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARK3P27448 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARK3P27448 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARK3P27448 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MARK3P27448 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARK3P27448 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARK3P27448 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARK3P27448 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARK3P27448 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARK3P27448 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARK3P27448 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARK3P27448 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARK3P27448 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARK3P27448 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARK3P27448 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARK3P27448 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARK3P27448 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARK3P27448 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARK3P27448 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARK3P27448 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MARK3P27448 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARK3P27448 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARK3P27448 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARK3P27448 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MARK3P27448 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARK3P27448 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MARK3P27448 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MARK3P27448 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARK3P27448 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARK3P27448 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARK3P27448 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARK3P27448 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARK3P27448 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARK3P27448 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARK3P27448 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARK3P27448 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARK3P27448 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MARK3P27448 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARK3P27448 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARK3P27448 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARK3P27448 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARK3P27448 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARK3P27448 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARK3P27448 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARK3P27448 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARK3P27448 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARK3P27448 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARK3P27448 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARK3P27448 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARK3P27448 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARK3P27448 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARK3P27448 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARK3P27448 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARK3P27448 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARK3P27448 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARK3P27448 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MARK3P27448 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARK3P27448 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARK3P27448 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARK3P27448 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARK3P27448 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARK3P27448 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARK3P27448 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARK3P27448 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARK3P27448 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARK3P27448 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARK3P27448 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARK3P27448 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARK3P27448 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARK3P27448 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARK3P27448 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARK3P27448 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms