Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
DNMT1P26358 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
DNMT1P26358 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
DNMT1P26358 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
DNMT1P26358 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
DNMT1P26358 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
DNMT1P26358 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
DNMT1P26358 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
DNMT1P26358 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
DNMT1P26358 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
DNMT1P26358 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
DNMT1P26358 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
DNMT1P26358 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
DNMT1P26358 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
DNMT1P26358 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
DNMT1P26358 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
DNMT1P26358 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
DNMT1P26358 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
DNMT1P26358 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
DNMT1P26358 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
DNMT1P26358 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
DNMT1P26358 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
DNMT1P26358 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
DNMT1P26358 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
DNMT1P26358 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
DNMT1P26358 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
DNMT1P26358 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
DNMT1P26358 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
DNMT1P26358 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
DNMT1P26358 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
DNMT1P26358 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
DNMT1P26358 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
DNMT1P26358 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
DNMT1P26358 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
DNMT1P26358 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
DNMT1P26358 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
DNMT1P26358 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
DNMT1P26358 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
DNMT1P26358 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
DNMT1P26358 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
DNMT1P26358 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
DNMT1P26358 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
DNMT1P26358 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
DNMT1P26358 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
DNMT1P26358 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
DNMT1P26358 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
DNMT1P26358 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC33.06■■■□□ 2.88
DNMT1P26358 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
DNMT1P26358 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
DNMT1P26358 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
DNMT1P26358 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
DNMT1P26358 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
DNMT1P26358 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
DNMT1P26358 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
DNMT1P26358 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC33.05■■■□□ 2.88
DNMT1P26358 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
DNMT1P26358 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
DNMT1P26358 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
DNMT1P26358 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
DNMT1P26358 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms