Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMA3P25788 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms