Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VAMP1P23763 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAMP1P23763 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms