Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6KB1P23443 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6KB1P23443 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6KB1P23443 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6KB1P23443 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6KB1P23443 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6KB1P23443 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6KB1P23443 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPS6KB1P23443 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6KB1P23443 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6KB1P23443 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6KB1P23443 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6KB1P23443 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6KB1P23443 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6KB1P23443 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6KB1P23443 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6KB1P23443 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6KB1P23443 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6KB1P23443 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6KB1P23443 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6KB1P23443 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6KB1P23443 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6KB1P23443 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPS6KB1P23443 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPS6KB1P23443 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPS6KB1P23443 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPS6KB1P23443 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPS6KB1P23443 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RPS6KB1P23443 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPS6KB1P23443 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPS6KB1P23443 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RPS6KB1P23443 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RPS6KB1P23443 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPS6KB1P23443 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms