Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLDCP23378 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLDCP23378 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GLDCP23378 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLDCP23378 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLDCP23378 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLDCP23378 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLDCP23378 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLDCP23378 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLDCP23378 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLDCP23378 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLDCP23378 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLDCP23378 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLDCP23378 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLDCP23378 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLDCP23378 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLDCP23378 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLDCP23378 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLDCP23378 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLDCP23378 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLDCP23378 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLDCP23378 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLDCP23378 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLDCP23378 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLDCP23378 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GLDCP23378 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLDCP23378 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLDCP23378 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLDCP23378 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLDCP23378 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLDCP23378 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLDCP23378 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLDCP23378 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLDCP23378 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLDCP23378 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLDCP23378 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLDCP23378 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLDCP23378 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLDCP23378 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLDCP23378 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLDCP23378 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLDCP23378 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLDCP23378 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GLDCP23378 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLDCP23378 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GLDCP23378 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLDCP23378 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLDCP23378 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLDCP23378 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLDCP23378 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLDCP23378 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLDCP23378 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLDCP23378 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLDCP23378 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLDCP23378 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GLDCP23378 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GLDCP23378 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLDCP23378 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLDCP23378 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLDCP23378 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLDCP23378 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLDCP23378 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLDCP23378 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLDCP23378 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GLDCP23378 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLDCP23378 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLDCP23378 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLDCP23378 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLDCP23378 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLDCP23378 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLDCP23378 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLDCP23378 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLDCP23378 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLDCP23378 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GLDCP23378 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLDCP23378 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLDCP23378 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLDCP23378 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLDCP23378 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLDCP23378 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLDCP23378 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLDCP23378 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLDCP23378 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLDCP23378 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLDCP23378 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLDCP23378 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLDCP23378 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLDCP23378 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLDCP23378 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLDCP23378 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLDCP23378 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLDCP23378 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLDCP23378 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLDCP23378 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLDCP23378 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLDCP23378 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLDCP23378 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLDCP23378 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLDCP23378 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLDCP23378 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms