Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD247P20963 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CD247P20963 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD247P20963 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD247P20963 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD247P20963 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD247P20963 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CD247P20963 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD247P20963 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD247P20963 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD247P20963 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD247P20963 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD247P20963 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD247P20963 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD247P20963 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD247P20963 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD247P20963 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD247P20963 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD247P20963 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD247P20963 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD247P20963 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD247P20963 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD247P20963 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD247P20963 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD247P20963 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD247P20963 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD247P20963 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD247P20963 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD247P20963 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD247P20963 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CD247P20963 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD247P20963 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD247P20963 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD247P20963 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD247P20963 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CD247P20963 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD247P20963 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD247P20963 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD247P20963 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD247P20963 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD247P20963 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD247P20963 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD247P20963 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD247P20963 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD247P20963 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD247P20963 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD247P20963 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD247P20963 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD247P20963 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD247P20963 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD247P20963 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD247P20963 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD247P20963 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD247P20963 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CD247P20963 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD247P20963 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD247P20963 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD247P20963 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD247P20963 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD247P20963 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CD247P20963 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD247P20963 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD247P20963 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD247P20963 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CD247P20963 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CD247P20963 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
CD247P20963 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD247P20963 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD247P20963 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD247P20963 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD247P20963 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD247P20963 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD247P20963 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD247P20963 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD247P20963 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD247P20963 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD247P20963 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD247P20963 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD247P20963 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD247P20963 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD247P20963 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD247P20963 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD247P20963 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD247P20963 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD247P20963 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD247P20963 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD247P20963 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD247P20963 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD247P20963 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD247P20963 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD247P20963 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD247P20963 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD247P20963 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD247P20963 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD247P20963 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD247P20963 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD247P20963 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD247P20963 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD247P20963 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD247P20963 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms