Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BPBP20851 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BPBP20851 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms