Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASTP20810 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASTP20810 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASTP20810 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASTP20810 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASTP20810 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASTP20810 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASTP20810 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CASTP20810 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASTP20810 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASTP20810 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CASTP20810 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASTP20810 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CASTP20810 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASTP20810 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASTP20810 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASTP20810 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASTP20810 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CASTP20810 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASTP20810 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASTP20810 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASTP20810 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASTP20810 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASTP20810 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASTP20810 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASTP20810 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASTP20810 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASTP20810 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASTP20810 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASTP20810 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASTP20810 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASTP20810 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASTP20810 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CASTP20810 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CASTP20810 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CASTP20810 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASTP20810 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASTP20810 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASTP20810 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASTP20810 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASTP20810 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASTP20810 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CASTP20810 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASTP20810 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASTP20810 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASTP20810 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASTP20810 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASTP20810 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASTP20810 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASTP20810 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASTP20810 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASTP20810 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASTP20810 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASTP20810 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASTP20810 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASTP20810 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASTP20810 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASTP20810 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CASTP20810 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASTP20810 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASTP20810 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASTP20810 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASTP20810 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASTP20810 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASTP20810 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASTP20810 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASTP20810 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASTP20810 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASTP20810 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASTP20810 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASTP20810 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASTP20810 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASTP20810 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASTP20810 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASTP20810 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASTP20810 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASTP20810 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASTP20810 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASTP20810 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASTP20810 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASTP20810 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASTP20810 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASTP20810 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASTP20810 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASTP20810 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASTP20810 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASTP20810 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CASTP20810 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASTP20810 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASTP20810 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASTP20810 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASTP20810 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASTP20810 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CASTP20810 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CASTP20810 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CASTP20810 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CASTP20810 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASTP20810 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASTP20810 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASTP20810 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms