Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCNA2P20248 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms