Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A1P19634 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms