Protein–RNA interactions for Protein: P19623

SRM, Spermidine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRMP19623 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRMP19623 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRMP19623 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SRMP19623 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRMP19623 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRMP19623 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRMP19623 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRMP19623 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRMP19623 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRMP19623 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRMP19623 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRMP19623 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRMP19623 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRMP19623 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRMP19623 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRMP19623 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRMP19623 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRMP19623 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRMP19623 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRMP19623 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRMP19623 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRMP19623 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRMP19623 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SRMP19623 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRMP19623 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRMP19623 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRMP19623 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRMP19623 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRMP19623 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRMP19623 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRMP19623 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SRMP19623 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRMP19623 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRMP19623 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRMP19623 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRMP19623 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRMP19623 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRMP19623 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRMP19623 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRMP19623 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRMP19623 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRMP19623 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRMP19623 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SRMP19623 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRMP19623 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRMP19623 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRMP19623 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRMP19623 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRMP19623 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRMP19623 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRMP19623 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRMP19623 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRMP19623 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRMP19623 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRMP19623 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRMP19623 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRMP19623 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRMP19623 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRMP19623 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRMP19623 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRMP19623 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRMP19623 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRMP19623 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRMP19623 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRMP19623 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRMP19623 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRMP19623 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRMP19623 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRMP19623 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRMP19623 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRMP19623 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRMP19623 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRMP19623 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRMP19623 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRMP19623 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRMP19623 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRMP19623 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRMP19623 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRMP19623 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SRMP19623 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRMP19623 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRMP19623 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRMP19623 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRMP19623 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRMP19623 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRMP19623 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRMP19623 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRMP19623 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRMP19623 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRMP19623 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRMP19623 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRMP19623 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRMP19623 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRMP19623 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRMP19623 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRMP19623 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRMP19623 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SRMP19623 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRMP19623 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SRMP19623 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms