Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT4P19013 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT4P19013 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT4P19013 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT4P19013 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT4P19013 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT4P19013 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT4P19013 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT4P19013 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT4P19013 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT4P19013 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT4P19013 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT4P19013 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT4P19013 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT4P19013 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT4P19013 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT4P19013 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT4P19013 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT4P19013 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT4P19013 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT4P19013 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT4P19013 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT4P19013 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT4P19013 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT4P19013 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT4P19013 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT4P19013 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT4P19013 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT4P19013 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT4P19013 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT4P19013 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT4P19013 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT4P19013 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT4P19013 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT4P19013 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT4P19013 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT4P19013 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT4P19013 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT4P19013 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT4P19013 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT4P19013 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT4P19013 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT4P19013 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT4P19013 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT4P19013 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT4P19013 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT4P19013 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT4P19013 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT4P19013 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT4P19013 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT4P19013 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT4P19013 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT4P19013 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT4P19013 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT4P19013 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KRT4P19013 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KRT4P19013 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KRT4P19013 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT4P19013 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT4P19013 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT4P19013 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT4P19013 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT4P19013 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT4P19013 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT4P19013 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT4P19013 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT4P19013 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT4P19013 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT4P19013 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT4P19013 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT4P19013 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT4P19013 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT4P19013 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT4P19013 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT4P19013 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT4P19013 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT4P19013 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT4P19013 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT4P19013 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT4P19013 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT4P19013 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT4P19013 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT4P19013 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT4P19013 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT4P19013 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT4P19013 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT4P19013 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT4P19013 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT4P19013 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT4P19013 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT4P19013 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT4P19013 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT4P19013 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT4P19013 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT4P19013 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT4P19013 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT4P19013 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT4P19013 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT4P19013 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT4P19013 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms