Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF6P18850 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF6P18850 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF6P18850 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF6P18850 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF6P18850 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF6P18850 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF6P18850 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF6P18850 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF6P18850 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF6P18850 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF6P18850 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF6P18850 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF6P18850 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF6P18850 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF6P18850 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF6P18850 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF6P18850 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF6P18850 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF6P18850 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF6P18850 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF6P18850 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF6P18850 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF6P18850 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF6P18850 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF6P18850 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF6P18850 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF6P18850 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF6P18850 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF6P18850 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF6P18850 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF6P18850 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF6P18850 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF6P18850 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF6P18850 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF6P18850 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF6P18850 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF6P18850 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF6P18850 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF6P18850 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF6P18850 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF6P18850 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF6P18850 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF6P18850 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF6P18850 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF6P18850 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF6P18850 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF6P18850 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATF6P18850 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATF6P18850 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATF6P18850 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATF6P18850 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATF6P18850 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATF6P18850 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATF6P18850 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATF6P18850 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATF6P18850 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATF6P18850 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATF6P18850 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATF6P18850 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATF6P18850 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF6P18850 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF6P18850 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF6P18850 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF6P18850 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF6P18850 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF6P18850 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF6P18850 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF6P18850 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF6P18850 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF6P18850 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF6P18850 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF6P18850 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF6P18850 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF6P18850 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF6P18850 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF6P18850 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF6P18850 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF6P18850 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF6P18850 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF6P18850 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF6P18850 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF6P18850 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF6P18850 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF6P18850 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF6P18850 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF6P18850 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF6P18850 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF6P18850 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF6P18850 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF6P18850 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF6P18850 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF6P18850 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF6P18850 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF6P18850 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF6P18850 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF6P18850 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF6P18850 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF6P18850 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF6P18850 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms