Protein–RNA interactions for Protein: P18848

ATF4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF4P18848 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATF4P18848 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATF4P18848 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATF4P18848 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATF4P18848 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATF4P18848 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATF4P18848 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATF4P18848 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATF4P18848 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATF4P18848 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATF4P18848 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATF4P18848 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATF4P18848 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATF4P18848 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATF4P18848 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATF4P18848 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATF4P18848 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATF4P18848 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATF4P18848 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATF4P18848 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATF4P18848 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATF4P18848 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATF4P18848 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATF4P18848 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATF4P18848 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATF4P18848 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATF4P18848 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATF4P18848 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATF4P18848 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATF4P18848 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATF4P18848 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATF4P18848 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATF4P18848 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATF4P18848 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATF4P18848 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATF4P18848 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATF4P18848 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATF4P18848 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATF4P18848 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATF4P18848 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATF4P18848 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATF4P18848 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATF4P18848 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATF4P18848 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATF4P18848 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATF4P18848 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATF4P18848 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATF4P18848 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATF4P18848 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATF4P18848 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATF4P18848 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATF4P18848 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATF4P18848 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATF4P18848 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATF4P18848 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATF4P18848 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATF4P18848 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATF4P18848 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATF4P18848 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATF4P18848 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATF4P18848 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATF4P18848 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATF4P18848 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATF4P18848 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATF4P18848 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATF4P18848 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATF4P18848 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATF4P18848 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATF4P18848 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATF4P18848 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATF4P18848 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATF4P18848 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATF4P18848 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATF4P18848 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF4P18848 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF4P18848 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF4P18848 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF4P18848 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF4P18848 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF4P18848 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF4P18848 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF4P18848 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF4P18848 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF4P18848 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF4P18848 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF4P18848 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF4P18848 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF4P18848 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF4P18848 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF4P18848 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF4P18848 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF4P18848 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF4P18848 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF4P18848 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF4P18848 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF4P18848 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF4P18848 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF4P18848 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF4P18848 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF4P18848 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms