Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA2P17301 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA2P17301 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA2P17301 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA2P17301 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA2P17301 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA2P17301 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA2P17301 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA2P17301 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA2P17301 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA2P17301 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA2P17301 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA2P17301 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA2P17301 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA2P17301 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA2P17301 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA2P17301 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA2P17301 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA2P17301 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA2P17301 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms