Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOT1P17174 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOT1P17174 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOT1P17174 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GOT1P17174 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOT1P17174 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOT1P17174 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GOT1P17174 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOT1P17174 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOT1P17174 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GOT1P17174 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOT1P17174 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOT1P17174 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOT1P17174 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOT1P17174 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOT1P17174 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOT1P17174 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOT1P17174 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOT1P17174 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOT1P17174 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOT1P17174 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOT1P17174 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GOT1P17174 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOT1P17174 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOT1P17174 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOT1P17174 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOT1P17174 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOT1P17174 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOT1P17174 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOT1P17174 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOT1P17174 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOT1P17174 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOT1P17174 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOT1P17174 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOT1P17174 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOT1P17174 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GOT1P17174 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOT1P17174 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOT1P17174 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOT1P17174 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOT1P17174 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOT1P17174 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GOT1P17174 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOT1P17174 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOT1P17174 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOT1P17174 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOT1P17174 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOT1P17174 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOT1P17174 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOT1P17174 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOT1P17174 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GOT1P17174 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GOT1P17174 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOT1P17174 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOT1P17174 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOT1P17174 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOT1P17174 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOT1P17174 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOT1P17174 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOT1P17174 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOT1P17174 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOT1P17174 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOT1P17174 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOT1P17174 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOT1P17174 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOT1P17174 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOT1P17174 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOT1P17174 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOT1P17174 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOT1P17174 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GOT1P17174 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOT1P17174 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOT1P17174 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOT1P17174 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOT1P17174 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GOT1P17174 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOT1P17174 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOT1P17174 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOT1P17174 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOT1P17174 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOT1P17174 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOT1P17174 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOT1P17174 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOT1P17174 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOT1P17174 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOT1P17174 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOT1P17174 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOT1P17174 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOT1P17174 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GOT1P17174 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOT1P17174 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOT1P17174 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOT1P17174 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOT1P17174 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOT1P17174 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOT1P17174 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOT1P17174 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GOT1P17174 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOT1P17174 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOT1P17174 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms