Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CD46P15529 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD46P15529 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD46P15529 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CD46P15529 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD46P15529 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CD46P15529 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD46P15529 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CD46P15529 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD46P15529 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD46P15529 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CD46P15529 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD46P15529 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD46P15529 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD46P15529 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD46P15529 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CD46P15529 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD46P15529 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD46P15529 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD46P15529 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD46P15529 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD46P15529 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CD46P15529 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD46P15529 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD46P15529 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD46P15529 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD46P15529 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD46P15529 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD46P15529 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD46P15529 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD46P15529 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD46P15529 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD46P15529 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD46P15529 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD46P15529 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD46P15529 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD46P15529 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD46P15529 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD46P15529 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD46P15529 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CD46P15529 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD46P15529 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD46P15529 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD46P15529 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD46P15529 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD46P15529 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD46P15529 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD46P15529 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD46P15529 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CD46P15529 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD46P15529 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD46P15529 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD46P15529 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD46P15529 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD46P15529 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD46P15529 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD46P15529 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD46P15529 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD46P15529 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD46P15529 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD46P15529 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CD46P15529 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD46P15529 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD46P15529 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD46P15529 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD46P15529 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD46P15529 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD46P15529 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD46P15529 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD46P15529 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD46P15529 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD46P15529 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD46P15529 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD46P15529 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD46P15529 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD46P15529 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD46P15529 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD46P15529 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD46P15529 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD46P15529 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD46P15529 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD46P15529 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD46P15529 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD46P15529 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CD46P15529 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CD46P15529 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD46P15529 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD46P15529 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD46P15529 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD46P15529 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD46P15529 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD46P15529 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD46P15529 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD46P15529 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD46P15529 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CD46P15529 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD46P15529 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD46P15529 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD46P15529 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD46P15529 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms