Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT10P13645 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT10P13645 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT10P13645 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT10P13645 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT10P13645 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT10P13645 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT10P13645 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT10P13645 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT10P13645 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT10P13645 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT10P13645 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT10P13645 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT10P13645 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT10P13645 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT10P13645 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT10P13645 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT10P13645 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT10P13645 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT10P13645 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT10P13645 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT10P13645 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT10P13645 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT10P13645 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT10P13645 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT10P13645 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT10P13645 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT10P13645 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT10P13645 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT10P13645 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT10P13645 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT10P13645 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT10P13645 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT10P13645 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT10P13645 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT10P13645 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT10P13645 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT10P13645 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT10P13645 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT10P13645 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT10P13645 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT10P13645 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT10P13645 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT10P13645 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT10P13645 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT10P13645 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT10P13645 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT10P13645 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT10P13645 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT10P13645 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT10P13645 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT10P13645 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT10P13645 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT10P13645 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT10P13645 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT10P13645 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT10P13645 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT10P13645 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT10P13645 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT10P13645 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT10P13645 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT10P13645 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT10P13645 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT10P13645 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT10P13645 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT10P13645 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT10P13645 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT10P13645 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT10P13645 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT10P13645 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT10P13645 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT10P13645 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT10P13645 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT10P13645 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT10P13645 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT10P13645 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT10P13645 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT10P13645 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT10P13645 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT10P13645 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT10P13645 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT10P13645 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT10P13645 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT10P13645 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT10P13645 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT10P13645 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT10P13645 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT10P13645 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT10P13645 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT10P13645 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT10P13645 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT10P13645 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT10P13645 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT10P13645 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT10P13645 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT10P13645 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT10P13645 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT10P13645 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT10P13645 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT10P13645 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms