Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms